2.3.1 提交计算任务

（1）找课题组的师兄师姐或者超算管理员要一个用于向服务器提交VASP计算任务的脚本。

一般用VASP做DFT计算时，都是借助超算服务器实现（个人电脑算力不太够），所以需要一个脚本来告诉服务器，我需要调用多少算力（节点、核数），做什么任务的计算（运行VASP或者QE）。以下是PBS作业管理系统的提交脚本示意：

#!/bin/bash
#SBATCH --output=%j.out
#SBATCH --error=%j.err
#SBATCH -N 1
#SBATCH -p small_s
#SBATCH --ntasks-per-node=32
#SBATCH --job-name=vasp
#SBATCH -t 48:00:00
#SBATCH --mem-per-cpu=4G

module load oneapi/2023.2
module load gcc/12.1
#source /public/software/intel/oneapi2021/setvars.sh

vasp=/public/software/vasp/vasp-6.4.1-gam-ncl-std/bin/vasp_std
#vasp=/public/software/vasp/vasp-6.4.1-gam-ncl-std/bin/vasp_gam
#vasp=/public/software/vasp/vasp-6.4.1-gam-ncl-std/bin/vasp_ncl

mpirun -np $SLURM_NTASKS $vasp > result

前两个红框意思是：调用用1个节点，32个核。这个文件直接决定了做VASP计算时可以调用的cpu计算资源（核数和内存），核数越多一般内存越大。核数设置一般需要经验，常见服务器单节点可以用的核数一般是20/24/32/48/64这样的数字，需要咨询服务器的管理员。在不跨节点的情况下，一般核数越多，计算速度越快，并且可以调用的内存也越多。所以对于大体系（原子数多）或者类似杂化泛函的计算，建议使用更多的核数。常规的计算任务，核数接近原子数是比较有性价比的选择。不同服务器的情况不一样，因此对于初学者来说，该脚本中涉及的的节点、核数选取请务必咨询课题组师兄/师姐或者超算工程师。

后两个红框意思是：运行vasp_std程序开始计算，并把主要结果输出到result文件中。

注意：当你有了任务提交脚本之后，你需要确保前面的四个文件INCAR，POSCAR，KPOINTS和POTCAR，以及任务脚本一共4+1个文件处于同一目录下

（2）根据任务管理系统对应的提交命令，提交任务。

咨询课题组师兄师姐相关的任务提交命令。不同服务器可能有不同的任务管理系统，常见的三种任务管理系统以及对应的任务提交命令如下：

SLURM任务管理系统，sbatch vasp641.slurm

PBS任务管理系统，qsub vasp641.pbs

LSF 任务管理系统，bsub < vasp641.sub （多了个< 需要在键盘英文模式下输入）

任务提交脚本文件名字以及后缀不重要，随个人喜好即可。

（3）任务提交之后，你需要查看任务是否在排队，还是在计算中，或是被异常中止。

对于SLURM任务系统，通过squeue查看任务情况；

对于PBS任务管理系统，通过qstat查看；

对于LSF任务管理系统，通过bjobs查看；

请自行网上查询对应的任务管理系统更详细的命令用法。